E6路（大站快车）：龙岗汽车总站→香港大学深圳医院（需在福田交通枢纽换乘M561）

高快巴士60路：龙岗中心城→香港大学深圳医院（早高峰班次，需提前查询）

福田/南山方向

M561路：侨城东地铁站→香港大学深圳医院（西门）

B706路：深南香蜜立交→香港大学深圳医院（东门）

M487路：红树湾地铁站→香港大学深圳医院（东门）

B729路：白石洲东→香港大学深圳医院（经停东门）

宝安区方向

M413路：沙井中心客运站→福田交通枢纽，换乘M561路直达。

乘坐1号线罗宝线，于侨城东站下车（C1出口）步行约10分钟

乘坐9号线，于深圳湾公园站下车（D1出口）步行约5分钟

西门（海园一路）：为就诊车辆主要出入口，设有2道入口2道出口，24小时开放。同时，医院为出租车配备了专用快速通道。
北门（白石路）：仅出口，开放时间24小时。
南门（滨海大道）：设置车辆出入口。